阳光明媚的一天，柯南（高山南 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们随同毛利小五郎（小山力也 配音）来到大阪，参加在当地举行的“高中生皋月杯”百人一首和歌大赛。期间，他们还见到了彼此的好友服部平次（堀川亮 配音）和远山和叶（宫村优子 配音）。就在比赛进行中途，一封爆炸预告信送到电

　　高木护（阿部真夫 饰）是一家文具公司售后部的职员。一天，在同学聚会上遇上了多年未见的棒球部好友世仓纯一郎（葛山信吾 饰），交谈中得知他离婚后独自带着双胞胎笹仓薰（芦田爱菜 饰）和笹仓友树（铃木福 饰）生活着，护回想自己到现在连个女朋友都没有，心生感慨。翌日，护和同事拜访客户后回到公司，接到了纯一

　　新的一年，明修学苑理事长樱井凉子（黑木瞳 饰）带领麾下精英开赴湘南，宣布合并后的明修湘南高中的成立。内山田广志（田山凉成 饰）任副校长，而鬼冢英吉（AKIRA 饰）则担任2年A班的副班主任。与此同时，弹间龙二（城田优 饰）和冴岛俊行（山本裕典 饰）也因各种原因回到故乡，曾经大闹湘南的坏小孩们重聚